اکثر چین خوردگی های این استان مربوط به دوران سوم زمین شناسی است به همین دلیل دارای ارتفاعات بلند، جوان، ممتد و پیوسته است که از طبقات آهکی تشکیل شده اند. ساختار زمین شناسی کوههای استان چهارمحال و بختیاری شباهت زیادی به ساختمان زمین شناسی استان لرستان دارد.